Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IRF8Q02556 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms