Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF17Q02223 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms