Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MDM2Q00987 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MDM2Q00987 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms