Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDK17Q00537 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK17Q00537 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms