Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HOXC5Q00444 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms