Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GTF2BQ00403 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms