Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPM4P67936 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPM4P67936 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TPM4P67936 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TPM4P67936 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPM4P67936 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPM4P67936 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPM4P67936 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPM4P67936 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPM4P67936 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPM4P67936 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPM4P67936 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPM4P67936 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPM4P67936 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPM4P67936 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPM4P67936 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPM4P67936 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPM4P67936 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPM4P67936 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPM4P67936 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TPM4P67936 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms