Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RPS29P62273 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RPS29P62273 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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