Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms