Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HDAC4P56524 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms