Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PAX9P55771 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PAX9P55771 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PAX9P55771 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PAX9P55771 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PAX9P55771 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms