Protein–RNA interactions for Protein: P55083

MFAP4, Microfibril-associated glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP4P55083 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MFAP4P55083 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms