Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms