Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AP2S1P53680 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms