Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACLYP53396 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACLYP53396 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ACLYP53396 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACLYP53396 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACLYP53396 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACLYP53396 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACLYP53396 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACLYP53396 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACLYP53396 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACLYP53396 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACLYP53396 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACLYP53396 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACLYP53396 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ACLYP53396 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ACLYP53396 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms