Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP11P51784 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP11P51784 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
USP11P51784 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
USP11P51784 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP11P51784 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
USP11P51784 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
USP11P51784 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms