Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms