Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUFMP49411 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUFMP49411 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUFMP49411 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TUFMP49411 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUFMP49411 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TUFMP49411 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TUFMP49411 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TUFMP49411 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUFMP49411 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUFMP49411 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUFMP49411 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUFMP49411 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUFMP49411 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUFMP49411 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TUFMP49411 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUFMP49411 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUFMP49411 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUFMP49411 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TUFMP49411 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUFMP49411 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TUFMP49411 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TUFMP49411 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUFMP49411 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUFMP49411 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUFMP49411 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUFMP49411 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUFMP49411 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUFMP49411 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUFMP49411 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUFMP49411 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TUFMP49411 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TUFMP49411 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms