Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GNPDA1P46926 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GNPDA1P46926 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms