Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SSR1P43307 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SSR1P43307 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSR1P43307 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSR1P43307 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSR1P43307 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSR1P43307 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSR1P43307 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSR1P43307 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSR1P43307 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSR1P43307 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SSR1P43307 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSR1P43307 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSR1P43307 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSR1P43307 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSR1P43307 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SSR1P43307 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SSR1P43307 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SSR1P43307 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms