Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTGIRP43119 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTGIRP43119 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms