Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC1A4P43007 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms