Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RPL35P42766 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RPL35P42766 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RPL35P42766 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms