Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBEC1P41238 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
APOBEC1P41238 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms