Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CEACAM3P40198 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms