Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ACVR1BP36896 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms