Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KRT2P35908 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KRT2P35908 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRT2P35908 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KRT2P35908 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KRT2P35908 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms