Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCKARP32238 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCKARP32238 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCKARP32238 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCKARP32238 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCKARP32238 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
CCKARP32238 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCKARP32238 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCKARP32238 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCKARP32238 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCKARP32238 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 841.8 ms