Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND2P30279 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND2P30279 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCND2P30279 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCND2P30279 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCND2P30279 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCND2P30279 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCND2P30279 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCND2P30279 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCND2P30279 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms