Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SSFA2P28290 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms