Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCP2P22307 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCP2P22307 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCP2P22307 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCP2P22307 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCP2P22307 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCP2P22307 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCP2P22307 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCP2P22307 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCP2P22307 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCP2P22307 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms