Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CD53P19397 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CD53P19397 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD53P19397 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD53P19397 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD53P19397 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD53P19397 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD53P19397 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD53P19397 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD53P19397 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD53P19397 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD53P19397 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD53P19397 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD53P19397 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD53P19397 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD53P19397 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms