Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCLP19338 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCLP19338 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCLP19338 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCLP19338 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCLP19338 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCLP19338 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NCLP19338 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCLP19338 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms