Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CAPN2P17655 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms