Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXB4P17483 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms