Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCL3L1P16619 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCL3L1P16619 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms