Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF2RAP15509 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF2RAP15509 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF2RAP15509 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF2RAP15509 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSF2RAP15509 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CSF2RAP15509 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2RAP15509 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2RAP15509 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2RAP15509 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2RAP15509 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2RAP15509 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2RAP15509 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2RAP15509 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2RAP15509 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2RAP15509 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2RAP15509 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2RAP15509 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CSF2RAP15509 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms