Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HLA-DOBP13765 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HLA-DOBP13765 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms