Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A1P11836 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms