Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYNX1P0DP58 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LYNX1P0DP58 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms