Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CT47B1P0C2W7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CT47B1P0C2W7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CT47B1P0C2W7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47B1P0C2W7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47B1P0C2W7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47B1P0C2W7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47B1P0C2W7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47B1P0C2W7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47B1P0C2W7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47B1P0C2W7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CT47B1P0C2W7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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