Protein–RNA interactions for Protein: P08240

SRPRA, Signal recognition particle receptor subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRAP08240 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SRPRAP08240 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SRPRAP08240 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms