Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GJB1P08034 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJB1P08034 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB1P08034 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB1P08034 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB1P08034 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB1P08034 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB1P08034 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB1P08034 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB1P08034 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB1P08034 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB1P08034 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB1P08034 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB1P08034 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB1P08034 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB1P08034 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB1P08034 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB1P08034 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB1P08034 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB1P08034 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB1P08034 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB1P08034 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB1P08034 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB1P08034 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB1P08034 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms