Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGAVP06756 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGAVP06756 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms