Protein–RNA interactions for Protein: P03979

TRGV3, T cell receptor gamma variable 3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGV3P03979 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRGV3P03979 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms