Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A1P02462 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COL4A1P02462 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms