Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IGHV3-7P01780 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IGHV3-7P01780 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms