Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRD1O95696 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD1O95696 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD1O95696 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD1O95696 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD1O95696 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD1O95696 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD1O95696 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD1O95696 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD1O95696 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRD1O95696 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRD1O95696 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRD1O95696 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRD1O95696 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD1O95696 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD1O95696 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD1O95696 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD1O95696 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD1O95696 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD1O95696 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD1O95696 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD1O95696 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD1O95696 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD1O95696 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRD1O95696 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRD1O95696 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRD1O95696 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRD1O95696 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRD1O95696 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
BRD1O95696 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRD1O95696 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRD1O95696 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms