Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC2O95347 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC2O95347 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC2O95347 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMC2O95347 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC2O95347 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC2O95347 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC2O95347 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC2O95347 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC2O95347 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMC2O95347 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMC2O95347 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMC2O95347 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMC2O95347 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC2O95347 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC2O95347 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms