Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX4O95219 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX4O95219 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX4O95219 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNX4O95219 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX4O95219 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX4O95219 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX4O95219 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms